Bien que les infections fongiques participent de manière significative à la morbidité et à la mortalité humaines, l'efficacité de ces maladies sur la santé humaine n'est pas appréciée. Le diagnostic des infections fongiques est un défi, en particulier chez l'hôte immunodéprimé. Les signes et les symptômes ne sont pas spécifiques, la colonisation est difficile à distinguer de la maladie invasive, les hémocultures sont généralement négatives et les patients sont souvent incapables de subir des procédures de diagnostic invasives. La culture et l'examen microscopique restent le "gold standard" mais sont peu sensibles. Les tests d'antigènes tels que les systèmes de détection du glucane et du galactomannane sont les plus utilisés. Toutefois, la sensibilité et la spécificité de ces tests varient en fonction de la population de patients concernée. Les tests à base moléculaire ne sont pas encore validés cliniquement cependant Les progrès de la technologie moléculaire montrent un grand potentiel pour la détection et l'identification rapides des champignons à des fins médicales, scientifiques et commerciales. Cependant, certaines nouvelles méthodes telles que le MALDI-TOF MS est devenu la méthode standard pour l'identification de routine de la plupart des organismes microbiens dans les laboratoires cliniques et a largement remplacé les tests biochimiques.