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Dans ce travail, l'approche in silico pour l'identification et la caractérisation des miRNAs conservés dans les étiquettes de séquence exprimée (ESTs) de lentille est adoptée. Pour l'identification de nouveaux miRNAs dans la lentille, les séquences EST ont été recherchées pour l'homologie avec les miRNAs matures connus du royaume végétal Viridiplantae en utilisant BLASTN en ligne. L'identification computationnelle basée sur la génomique comparative a donné lieu à 12 candidats miRNA potentiels appartenant à 12 familles miRNA différentes dans la lentille. Enfin, en utilisant les miRNA potentiels…mehr

Produktbeschreibung
Dans ce travail, l'approche in silico pour l'identification et la caractérisation des miRNAs conservés dans les étiquettes de séquence exprimée (ESTs) de lentille est adoptée. Pour l'identification de nouveaux miRNAs dans la lentille, les séquences EST ont été recherchées pour l'homologie avec les miRNAs matures connus du royaume végétal Viridiplantae en utilisant BLASTN en ligne. L'identification computationnelle basée sur la génomique comparative a donné lieu à 12 candidats miRNA potentiels appartenant à 12 familles miRNA différentes dans la lentille. Enfin, en utilisant les miRNA potentiels de la lentille, un total de 25 gènes cibles ont été prédits et leurs fonctions probables ont été illustrées. La plupart des gènes cibles des miARN de la lentille semblent coder pour la croissance, le développement, le métabolisme et la réponse au stress, la résistance aux maladies, etc. Dans un avenir proche, une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires des miARN dans la plante de lentille pourrait aider au développement d'une technique nouvelle et précise pour comprendre certains mécanismes de silençage post-transcriptionnel des gènes en réponse à la tolérance au stress.
Autorenporträt
Le Dr. RISHEE K. KALARIA a terminé son doctorat en biologie moléculaire végétale et biotechnologie à l'Université agricole de Navsari en 2014. Actuellement, il travaille comme professeur adjoint à l'Institut de biotechnologie Aspee Shakilam, Université agricole de Navsari. Il est également en charge de la section bioinformatique.