Identification in silico des micrornas et de leurs cibles chez la lentille
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Dans ce travail, l'approche in silico pour l'identification et la caractérisation des miRNAs conservés dans les étiquettes de séquence exprimée (ESTs) de lentille est adoptée. Pour l'identification de nouveaux miRNAs dans la lentille, les séquences EST ont été recherchées pour l'homologie avec les miRNAs matures connus du royaume végétal Viridiplantae en utilisant BLASTN en ligne. L'identification computationnelle basée sur la génomique comparative a donné lieu à 12 candidats miRNA potentiels appartenant à 12 familles miRNA différentes dans la lentille. Enfin, en utilisant le...
Dans ce travail, l'approche in silico pour l'identification et la caractérisation des miRNAs conservés dans les étiquettes de séquence exprimée (ESTs) de lentille est adoptée. Pour l'identification de nouveaux miRNAs dans la lentille, les séquences EST ont été recherchées pour l'homologie avec les miRNAs matures connus du royaume végétal Viridiplantae en utilisant BLASTN en ligne. L'identification computationnelle basée sur la génomique comparative a donné lieu à 12 candidats miRNA potentiels appartenant à 12 familles miRNA différentes dans la lentille. Enfin, en utilisant les miRNA potentiels de la lentille, un total de 25 gènes cibles ont été prédits et leurs fonctions probables ont été illustrées. La plupart des gènes cibles des miARN de la lentille semblent coder pour la croissance, le développement, le métabolisme et la réponse au stress, la résistance aux maladies, etc. Dans un avenir proche, une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires des miARN dans la plante de lentille pourrait aider au développement d'une technique nouvelle et précise pour comprendre certains mécanismes de silençage post-transcriptionnel des gènes en réponse à la tolérance au stress.
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