Los ríos suelen constituir el principal vínculo entre ecosistemas que interactúan. La contaminación del agua tiene dos aspectos. El impacto humano se produce en sistemas acuáticos como ríos, humedales, embalses y aguas subterráneas. Los efectos indirectos están causados por el uso del suelo en las zonas de captación, como la deforestación, las plantaciones y los asentamientos humanos.El intenso desarrollo agrícola y urbano ha supuesto una gran demanda de recursos de aguas subterráneas en zonas urbanas de todo el mundo y también ha hecho que estos recursos corran un mayor riesgo de contaminación. El riesgo de contaminación de las aguas subterráneas depende de dos factores: (1) las propiedades intrínsecas del entorno hidrogeológico, principalmente factores que influyen en el transporte y la estabilidad de los contaminantes derivados de la superficie terrestre; y (2) la carga de contaminantes, principalmente de fuentes antropogénicas. En muchos casos, las zonas urbanas presentan tanto las propiedades intrínsecas como la carga de contaminantes que dan lugar a un alto riesgo de contaminación de las aguas subterráneas.
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