Unter den Nutztieren in Indien sind Rinder und Büffel von großer Bedeutung, die einen großen Beitrag zur Viehwirtschaft und damit zur Wirtschaft des Landes leisten. Im ganzen Land werden verschiedene Genomverbesserungsprogramme zur Verbesserung von Rinder- und Büffelrassen durchgeführt. Die Genomsequenzierung beider Arten ist fast abgeschlossen. Während das Rindergenom bereits vollständig sequenziert ist, ist das Büffelgenom nur in Ansätzen vorhanden, und das auch nur mit sehr geringem Umfang. Aus dem unvollendeten Genom des Büffels müssen unbedingt die für die Landwirtschaft wichtigen Gene herausgefunden werden. Dies ist nur möglich, indem man das Genom des Büffels durch eine vergleichende Analyse mit dem gut ausgearbeiteten Genom der Kuh, einem Mitglied seiner eigenen Familie, annotiert. Heutzutage sind Genom-Browser im Bereich der Genom-Annotation sehr beliebt, da sie die grafische Visualisierung von genomischen Elementen im Genom und den Vergleich des Genoms von zwei oder mehr Organismen erleichtern.