Empreendedorismo e inovação são aspectos cada vez mais relevantes no cenário mundial, principalmente em um momento em que empresas iniciantes buscam se enquadrar no modelo de Startups, incentivados pelos casos de sucesso de grandes companhias. Um dos agentes que permeia essa cadeia inovadora, que são as incubadoras, apresenta um papel diferenciado e diante disso este estudo se debruça sobre esse tema, investigando por meio de um estudo de caso de duas Instituições Representativas do Estado do Amazonas, que são as Instituições de Ensino FUNDAÇÃO CENTRO DE ANÁLISE, PESQUISA E INOVAÇÃO TECNOLÓGICA - FUCAPI E A FACULDADE MARTHA FALCÃO - FMF. As quais permitiram uma pequena amostra e retrato do movimento de incubadoras universitárias no Brasil.