I cianobatteri hanno un grande potenziale per servire l'umanità in molti modi. La natura diazotrofica, l'ampia distribuzione e la capacità di entrare in simbiosi di fissazione dell'azoto della BGA li rendono molto interessanti per la ricerca. In agricoltura, i cianobatteri hanno una lunga storia di utilizzo sotto forma di biofertilizzanti. Altre importanti applicazioni dei cianobatteri in diversi campi del benessere umano, come cibo e mangimi, nel biorisanamento di composti tossici, nel biocontrollo di parassiti, nella produzione di prodotti chimici commerciali e di laboratorio, di enzimi di restrizione, di strumenti farmacologici (Patterson, 1996) e di farmaci terapeutici per la gestione delle malattie e nel trattamento delle acque reflue e degli effluenti, compresa la rimozione di coloranti nocivi dagli effluenti tessili.
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