Introdução: As infecções associadas aos cuidados de saúde (IACS) são uma grande preocupação de saúde pública em todo o mundo, pelo que o nosso objetivo foi fornecer uma atualização sobre as IACS e elaborar um exemplo de protocolo para um inquérito de incidência e uma abordagem aos custos adicionais nos hospitais. Métodos:Foi efectuada uma revisão bibliográfica da literatura para fornecer uma revisão teórica e elaborar um protocolo. Resultados: O protocolo foi um estudo de coorte com recolha prospetiva de dados. Para estimar a incidência, utilizámos 3 indicadores epidemiológicos: a incidência cumulativa, a densidade de incidência e o rácio de exposição aos dispositivos médicos. Para avaliar o custo das IACS, interessou-nos o custo médico direto, que foi apresentado em termos de despesas ligadas à duração do internamento hospitalar (comparando os casos infectados com os controlos não infectados), bem como as despesas ligadas ao consumo de antibióticos necessários para estas infecções.Conclusão: É necessário introduzir em cada hospital um método de controlo regular da incidência e do custo destas infecções, a fim de as combater eficazmente.