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Le malattie infiammatorie intestinali (IBD, Inflammatory Bowel Diseases) sono malattie croniche ed immunomediate: la malattia di Crohn (Crohn's Disease, CD) e la rettocolite ulcerosa (RCU) rappresentano le due principali e più comuni tipologie di IBD. Nel 5-20% dei pazienti con esclusivo coinvolgimento colico, tuttavia, non è possibile operare con certezza tale distinzione: la malattia viene allora definita "colite non classificata" (IBDU, colonic IBD type unclassified). La RCU viene definita come una patologia cronica recidivante caratterizzata da flogosi continua e non transmurale della parete intestinale, limitata al colon-retto; la malattia di Crohn, invece, rappresenta una patologia cronica recidivante nella quale si osserva una flogosi transmurale parietale, che può coinvolgere, per definizione, l'intero tratto gastrointestinale, dalla bocca all'ano.