Las enzimas pueden inmovilizarse por atrapamiento en una matriz porosa, por encapsulación en una cápsula de membrana semipermeable o entre membranas, como en una unidad de fibra hueca, o por adsorción en una superficie de soporte sólido. La inmovilización de la enzima proporciona la utilización de la misma, elimina los costosos procesos de recuperación y purificación de la enzima, y puede resultar en una mayor actividad al proporcionar un microambiente más adecuado para la enzima. La inmovilización de la enzima puede dar lugar a limitaciones de difusión dentro de la matriz. La inmovilización también puede causar inestabilidad de la enzima, pérdida de actividad y un cambio en las condiciones óptimas (pH, fuerza iónica). Para obtener la máxima velocidad de reacción, es necesario optimizar el tamaño de las partículas del material de soporte y la carga de enzimas, y seleccionar un material de soporte con las características superficiales correctas.
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