A patogénese da periodontite na causa da doença sistémica não é ainda bem conhecida. Também é possível que a periodontite não esteja diretamente relacionada com a causa das condições sistémicas, mas ambas podem partilhar factores de risco comuns. Entre os factores e indicadores de risco ambientais partilhados pela periodontite e pelas doenças sistémicas (tais como as doenças cardiovasculares, a diabetes mellitus, as doenças respiratórias, a osteoporose, a artrite reumatoide e os resultados adversos da gravidez) encontram-se o tabagismo, o stress, o envelhecimento, a raça ou a etnia. As citocinas pró-inflamatórias TNF-a, IL-ip e interferão gama, bem como a prostaglandina E2 (PGE2), atingem concentrações tecidulares elevadas na periodontite. O periodonto pode servir como um reservatório renovador para o extravasamento destes mediadores, que podem entrar na circulação e induzir e perpetuar efeitos sistémicos. Se for devidamente identificada, a presença de periodontite num paciente ajudará a identificar estes factores de risco e alertará o médico para várias perturbações sistémicas.