Se establece una línea base de parámetros físicos (temperatura, radiación solar, velocidad y dirección del viento) para ser utilizados en el modelamiento de nichos ecológicos en la cuenca hidrográfica del río Napo, utilizando los resultados del modelo Weather Research and Forecasting para el año 2012. Estos fueron validados espacial y temporalmente, utilizando registros del Instituto Nacional de Meteorología e Hidrología del Ecuador. Adicionalmente, se realizó un inventario de emisiones de fuentes antropogénicas de contaminantes primarios (NOx, CO, COV, SO2, PM10, PM2.5) y de CO2 para la misma área, tomando como referencia el año 2012, contemplando las fuentes: plantas de generación eléctrica, tráfico vehicular, gasolineras y la refinería Amazonas y Planta de Gas. Cabe destacar que este esfuerzo representa es el primer inventario de emisiones atmosféricas que se desarrolla para la cuenca hidrográfica del río Napo y por ello constituye un hito importante para estudios ambientales de mayor alcance.