Las cianobacterias tienen un gran potencial para servir a la humanidad de muchas maneras. La naturaleza diazotrófica, el amplio patrón de distribución y la capacidad de entrar en simbiosis fijadora de N de las BGA las hacen muy atractivas para la investigación. En agricultura, las cianobacterias tienen una larga historia de uso en forma de biofertilizantes. Otras aplicaciones importantes de las cianobacterias en diversos campos del bienestar humano, como la alimentación humana y animal, en la biorremediación de compuestos tóxicos, en el biocontrol de plagas, la producción de productos químicos comerciales y de laboratorio, enzimas de restricción, herramientas farmacológicas (Patterson, 1996) y fármacos terapéuticos para el tratamiento de enfermedades y en el tratamiento de aguas residuales y efluentes, incluida la eliminación de colorantes nocivos de los efluentes textiles. De las asociaciones conocidas de cianobacterias con plantas, la más importante está relacionada con la fijación de carbono o nitrógeno.
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