A selecção do tratamento biológico depende da qualidade do efluente e da percentagem de remoção necessária. Os tratamentos biológicos são também utilizados para a remoção selectiva de muitos metais pesados, fósforo e outros poluentes, tendo-se verificado que a remoção de fenol utilizando a decomposição por várias vias bacterianas era uma alternativa viável e eficaz. A bioabsorção de fenol era um método simples e eficaz para a remoção de fenol. Tanto os processos de crescimento em suspensão como os ligados são investigados para a remoção do fenol e podem ser uma escolha potencialmente eficaz para a remoção biológica do fenol. O modo anaeróbico de tratamento biológico é muito eficaz para o tratamento de lamas domésticas e industriais contendo elevada carga orgânica. A tecnologia rentável com tamanho compacto do equipamento é sempre vantajosa na selecção do processo. As tecnologias disponíveis podem ser modificadas para as tornar cada vez mais eficazes em termos de custo. O acoplamento de duas operações ou processos unitários pode exibir excelentes resultados em alguns processos pode exibir excelentes resultados em alguns casos. A combinação de separação de membranas com reacção é considerada eficaz em algumas aplicações.
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