El tratamiento endodóntico es esencialmente un procedimiento de desbridamiento para interrumpir y eliminar el ecosistema microbiano asociado al proceso de la enfermedad. La causa principal del fracaso de la endodoncia son los microorganismos que quedan en el espacio del conducto radicular después del tratamiento o que se recolonizan en el sistema de conductos obturados. Para eliminar estos microorganismos, el objetivo principal del tratamiento endodóntico es optimizar la desinfección del conducto radicular y prevenir la reinfección limpiando el sistema de conductos radiculares a fondo y dejándolo libre de microbiota y residuos. Los medicamentos intracanales destruyen los microorganismos residuales, las toxinas y las bacterias residuales que no se consiguen eliminar mediante la preparación quimiomecánica. Los medicamentos intracanales previenen o controlan el dolor postoperatorio. Por lo tanto, la limpieza adecuada y la conformación del sistema de conductos radiculares es de vital importancia para el éxito del tratamiento endodóntico.