Il trattamento endodontico è essenzialmente una procedura di sbrigliamento per interrompere e rimuovere l'ecosistema microbico associato al processo patologico. La causa principale del fallimento endodontico sono i microrganismi presenti nello spazio canalare dopo il trattamento o che si ricolonizzano nel sistema canalare otturato. Per eliminare tali microrganismi, l'obiettivo primario del trattamento endodontico è ottimizzare la disinfezione del canale radicolare e prevenire una nuova infezione pulendo a fondo il sistema canalare e rendendolo libero da microbiota e detriti. I farmaci intracanalari distruggono i microrganismi, le tossine e i batteri residui che non riescono a essere rimossi dalla preparazione chemio-meccanica. I farmaci intracanali prevengono o controllano il dolore post operatorio. Pertanto, un'adeguata pulizia e sagomatura del sistema canalare è di fondamentale importanza per il successo del trattamento endodontico.