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Os microrganismos associados aos ambientes térmicos marinhos são geralmente descritos de quatro maneiras com base no seu habitat: os que se encontram nos espaços porosos e fissuras abaixo das superfícies; os que se encontram na superfície exterior dos depósitos de sulfureto, tipicamente como esteiras; os que se encontram sobre e dentro de invertebrados muitas vezes como simbiontes e os que se encontram dentro da pluma de fluido hidrotermais na água do mar sobrejacente. Um estudo envolveu uma estirpe moderadamente termófila do Bacillus, que cresce a 55-65ºc. Do mesmo modo, 10 estirpes de pseudoalteromonas sp, que crescem a 40-50ºc, de forma a reduzir o telúrio e a selenite. Os microrganismos são essenciais para a colonização inicial e requerem contacto físico entre bactérias colonizadoras e entre as bactérias e o seu hospedeiro. A mineralização biológica é submetida a dois processos. Por um método, a mineralização é orquestrada pelo organismo através de um processo de "matriz orgânica mediada". O outro método é caracterizado pela formação mineral extracelular/intercelular a granel. Este processo biológico resulta em produtos cristalinos semelhantes aos esperados pela cristalização a partir de soluções.