Markus Braga, Artur Sil'wa, Rommel' Ramos

Izbytok NGS Kontig w genomah prokariot

Nowyj podhod k obnaruzheniü i ustraneniü izbytochnosti w NGS Contigium pri zawershaüschej obrabotke genomow prokariot s ispol'zowaniem fil'tra Bluma i LSH

• Broschiertes Buch

Produktbeschreibung

V dannoj knigi predstawlen wychislitel'nyj metod dlq obnaruzheniq i ustraneniq izbytochnyh NGS kontirowok, wnow' generiruemyh assemblerami. V ätom podhode ispol'zuütsq dwe tehniki, osnowannye na häshirowanii: fil'tr Bluma (Bloom Filter) dlq ustraneniq dubliruüschih kontegow i häsh-funkciq, chuwstwitel'naq k mestopolozheniü (LSH), dlq ustraneniq analogichnyh kontegow. Poskol'ku bol'shoe kolichestwo kontingow generiruetsq raznymi sborschikami, äti podhody trebuüt znachitel'nyh wychislitel'nyh i chelowecheskih resursow. Sokraschenie izbytochnosti oblegchaet dal'nejshij analiz dannyh i sokraschaet wremq, neobhodimoe dlq dorabotki i izlecheniq genomnyh sborok. Gibridnaq sborka nabora dannyh GAGE-B (8 bakterij, razdelennyh na 12 posledowatel'nyh assamblej w Illumina HiSeq i MiSeq) byla wypolnena s assemblerom SPAdes (De Bruijn Graph) i assemblerom Fermi (OLC). Truboprowod byl primenen k rezul'tiruüschim probkam i proizwoditel'nosti po srawneniü s drugimi analogichnymi instrumentami, takimi kak HS-BLASTN, Simplifier i CD-HIT. Predlagaemoe prilozhenie mozhet generirowat' dopolnitel'nye rezul'taty i pomogaet ob#edinit' äti rezul'taty, delaq sborku bolee tochnoj.

Produktdetails

• Verlag: Sciencia Scripts
• Seitenzahl: 192
• Erscheinungstermin: 11. Juni 2020
• Russisch
• Abmessung: 220mm x 150mm x 12mm
• Gewicht: 304g
• ISBN-13: 9786202578448
• ISBN-10: 6202578440
• Artikelnr.: 59603149

Autorenporträt

Kandidat nauk po genetike i molekulqrnoj biologii - bioinformatike (ICB/UFPA). Magistr w oblasti älektrotehniki - prikladnye wychisleniq (ITEC/UFPA). Bakalawr komp'üternyh nauk (ICEN/UFPA). Ad#ünkt-professor Federal'nogo sel'skogo uniwersiteta w Amazonii - Kampus-de-Paragominas/Pa. Rukowoditel' Issledowatel'skoj gruppy po prikladnym wychisleniqm (CNPq/UFRA).