Tief im Inneren der Sidonia geht der Test mit Hybrid Nr. 2 in die letzte Phase. Doch aufgrund seiner instabilen Psyche rastet Kanata aus ... die Folge: schwere Schäden an der Sidonia und tote Besatzungsmitglieder. In Kanata ruht nämlich mit der Gravitonstrahlenkanone die ultimative Waffe, mit deren Herstellung sich Wissenschaftler Ochiai Jahrhunderte lang beschäftigt hatte!