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La ortodoncia, la disciplina más antigua de la especialidad odontológica, se ocupa del tratamiento de la maloclusión tanto dental como esquelética. Aunque la etiología de la maloclusión es multifactorial, los genes tienen influencia en esta condición, además de su papel en el mecanismo de movimiento de los dientes y secuelas no deseadas como la reabsorción radicular externa después del tratamiento de ortodoncia. Esta breve comunicación se centrará en el papel de los genes en diversas condiciones que tienen un efecto primordial en la etiología de la maloclusión o en el mecanismo por el que se produce el movimiento de los dientes. El proyecto del genoma humano y los futuros avances en medicina genómica nos ayudarán a identificar claramente las afecciones que causan mutaciones y a resolver el rompecabezas en zigzag de la interacción molecular.