L'une des conséquences du progrès technologique et de la révolution industrielle a été le rejet d'un grand nombre de produits chimiques dans l'environnement. La réponse du biote au stress de la pollution peut être observée aux niveaux de l'écosystème, de la communauté, de la population, de l'individu et du sous-organisme. Le niveau des polluants détectés dans les tissus des organismes est la seule mesure directe de la proportion de l'apport total de substances toxiques au biote, et indique donc la fraction qui est susceptible de pénétrer et d'affecter l'écosystème aquatique. La santé d'un écosystème aquatique peut être évaluée par aucune altération de l'organisation du biote au niveau de la population ou de la communauté. Les changements qui se produisent au niveau de la population et qui sont utilisés pour indiquer l'étendue de la pollution dans une zone sont appelés "indices biotiques", tandis que les altérations au niveau de la communauté sont généralement représentées par des "indices de diversité des espèces". Les modifications de la structure de la communauté se traduisent généralement par une diminution de la diversité des espèces.