La responsabilità di proteggere deve affrontare diverse sfide, tra cui l'inadeguata cooperazione tra le Nazioni Unite e le organizzazioni regionali, la mancanza di attenzione al "potere duro", la resistenza alle misure preventive, l'inadeguatezza dello Stato di diritto e dei meccanismi di responsabilità, la tendenza ricorrente a concentrarsi sulle risposte ai conflitti e ai crimini di atrocità invece che sulla prevenzione, la mancanza di volontà politica e di leadership necessarie per mobilitare le misure di prevenzione delle atrocità, l'accesso limitato e l'assegnazione di risorse alle misure di prevenzione come parte di una strategia di prevenzione a lungo termine, ecc. L'approvazione della responsabilità di proteggere comporta un significativo progresso per la comunità internazionale rispetto all'emergere del dibattito sull'intervento umanitario. In effetti, lo sviluppo di misure coercitive e non coercitive che possono essere utilizzate dalla comunità internazionale, e i principi di precauzione che le accompagnano nei casi in cui uno Stato non abbia adempiuto alla responsabilità di proteggere i propri cittadini, trasforma il principio di sovranità in un principio condizionale, senza lasciare da parte le preoccupazioni degli Stati che in precedenza sostenevano il diritto alla non ingerenza.