Este estudo apresenta de forma inédita o objetivo de realizar a secagem das cascas de C. limettioides Tan. aplicando modelagem matemática, quantificar o conteúdo fenólico e flavonoide total e avaliar o potencial antimicrobiano de nanoemulsão estável através de método de baixa energia.Através dos resultados obtidos foi possível determinar que o modelo matemático de Logarithm foi o que melhor se encaixava nos dados experimentais. O teor de fenólicos totais quantificado foi de 75,124 mg EAT g-1 e flavonoides de 99,22 mg EQT g-1. O OE e nanoemulsão apresentaram atividade fungicida frente a todos os microrganismos testados. Os resultados obtidos comprovam o potencial necessário para a aplicação do OE e nanoemulsão das cascas de C. limettioides Tan como antimicrobiano, incentivando o potencial de aplicação do OE.