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El fitoplancton son plantas microscópicas que flotan libremente y constituyen el componente básico de la cadena alimentaria acuática. Las diatomeas forman parte del fitoplancton. Las diatomeas están presentes en casi todos los medios acuáticos y son abundantes en la mayoría de ellos. Son sensibles a los cambios en la calidad del agua y muchos taxones tienen óptimos y tolerancia bien desarrollados. Debido a sus ciclos celulares cortos, son capaces de colonizar rápidamente nuevos hábitats, lo que provoca cambios en su comunidad y representa una respuesta rápida a los cambios medioambientales. El tiempo de respuesta de las diatomeas es un intermedio útil entre el muestreo físico-químico inmediato e infrecuente, en el que los cambios rápidos pueden dar lugar a fluctuaciones ecológicas significativas. Las diatomeas tienen un movimiento limitado entre hábitats, por lo que o bien se desarrollan bien en el entorno en el que se encuentran o no, de ahí que muchas especies tengan más probabilidades de encontrarse en hábitats con parámetros físicos y químicos específicos. Las diatomeas se utilizan cada vez más como indicadores biológicos, ya que responden con fuerza a los cambios medioambientales e integran las respuestas a una serie de contaminantes en las masas de agua a lo largo de diferentes escalas temporales y pueden utilizarse para comparar los cambios relativos de la calidad del agua de un lugar a otro.
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