Classé comme des véritables baromètres de l'environnement, les bio-indicateurs sont des agents indispensables et peu coûteux pour évaluer un milieu. Le lamantin d'Afrique est un animal bien particulier. Reconnu comme une espèce en voie de disparition par l'UICN, le lamantin d'Afrique demeure une espèce très peu étudiée, mais dont la fragilité biologique est bien réelle. L'objectif de ce travail est de démontrer que la distribution du lamantin dans l'écosystème lagunaire de Ndougou s'opère selon "une norme" bien définie des paramètres physico-chimiques de l'eau. La méthodologie reposait sur les interviews des communautés locales, l'analyse des paramètres physico-chimiques in-situs, la recherche documentaire et les transects par bateau. Les résultats présentent une distribution hétérogène avec une concentration dans la zone Ouest de la lagune. Les eaux de la lagune sont de bonne qualité (pH, Oxygène dissous...). La chasse et l'activité de pêche sont les menaces les plus importantes. La recherche des interactions potentielles entre la pêche et le lamantin sera indispensable pour une meilleure conservation de l'espèce.