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La cryptosporidiose est une parasitose émergente due à un protozoaire intracellulaire, Cryptosporidium sp. L'objectif de notre travail était de déterminer la prévalence du Cryptosporidium sp chez les sujets présentant des diarrhées il s'agit d'une étude prospective descriptive, transversale et analytique qui a été menée durant une période de 05 mois allant de 01/10/2016 à 28/02/2017. Elle a porté sur des échantillons de selles adressés au laboratoire de parasitologie du CHU Constantine. Chaque selle a bénéficié d'une concentration et d'une coloration (Ziehl Nelseen modifiée) à la recherche des oocystes de Cryptosporidium sp. Parmi les 80 prélèvements de selles examinés au cours de la période de notre étude, 6 se sont révélés positifs avec un taux de 7,5 %. La majorité des patients étaient des adultes de 37 à 50 ans, un seul enfant de 2 ans était colligé. La moitié des cas était des sujets fragilisés (VIH+, enfant de 2 ans, épisode d'amibiase). Dans notre étude l'examen microscopique était le seul moyen de diagnostic, l'utilisation de la PCR pour poser le diagnostic et identifier les espèces en cause serait souhaitable.