"Lektionen der Finsternis" spielt wie die Erzählung "Herz der Finsternis" von Joseph Conrad, auf die Gaston Salvatore mit dem Titel seines Stückes bewußt anspielt, im äquatorialen Afrika. 1967, zur Zeit des Vietnamkrieges und nach dem israelischen Sechstagekrieg, besucht eine israelische Delegation die Urwaldstation St. Ignace. Dr. Friedmann hat diese Krankenstation, die weltweit Beachtung findet, aufgebaut und leitet sie mit Hilfe seines schwarzen Stellvertreters und eines jungen amerikanischen Kollegen, der vorher als Militärarzt in Vietnam gewesen war. Die drei Israelis sind in einer geheimen Mission zu der in der Regenzeit nahezu von der Außenwelt abgeschlossenen Station gekommen; sie sollen herausfinden, ob es sich bei Friedmann um den KZ-Arzt Kurtz handelt, der im Kinderkrankenblock von Auschwitz Menschenversuche vorgenommen hatte.