La production et la commercialisation de l'oignon prend de plus en plus de l'ampleur au Burkina Faso ces dernières années. En effet, cette filière procure des revenus substantiels aux populations rurales. Toutefois l'activité est entrain d'être compromise par des problèmes parasitaires qui occasionnent des pourritures des bulbes en champ et au stockage. La présente étude s'est penchée sur le diagnostic et la caractérisation des agents pathogènes d'origine fongique associés à ces pourritures. Elle s'est terminée par l'élaboration et la proposition aux producteurs, d'une stratégie de protection intégrée de cette culture maraichère pour contrôler efficacement ces pourritures.