La catastrophe de la mer d'Aral a des répercussions négatives sur la situation environnementale et socio-économique, ainsi que sur le climat régional des pays du bassin de la mer d'Aral (BMA). Les deux plus grands fleuves transfrontaliers, l'Amou-Daria et le Syr-Daria, prennent leur source dans les hautes montagnes du Pamir et du Tien Shan. La présente étude fournit un aperçu quantitatif et qualitatif détaillé des rivières Amudarya et Syrdarya, ainsi que du drainage des collecteurs et des ressources en eau souterraine. En raison de l'aridité, l'agriculture dans la région de Boukhara dépend fortement de l'irrigation. Cependant, la topographie plate de la région ne permet pas un drainage naturel suffisant. Par conséquent, l'engorgement des eaux et l'élévation des nappes phréatiques constituent de sérieux problèmes pour la productivité agricole. En combinaison avec la forte salinisation de l'eau d'irrigation, cela conduit à une salinisation généralisée du sol. L'irrigation intensive, les ressources en eau saline, les nappes phréatiques peu profondes et les taux d'évaporation élevés entraînent un enrichissement en sels des sols superficiels et une réduction de la productivité des sols. Le système "eaux souterraines-sol-météorologie-irrigation" est extrêmement complexe, de sorte qu'il n'y a pas un seul paramètre qui contrôle le processus de salinisation.
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