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L'agricoltura biologica è fondamentalmente un sistema di gestione olistico, che promuove e migliora la salute dell'agroecosistema in relazione alla biodiversità, ai biocicli dei nutrienti, alle attività microbiche e biochimiche del suolo. Si tratta di pratiche di gestione che prevedono l'uso sostanziale di concimi organici, concimazione verde, pratiche di gestione organica dei parassiti e così via. Si tratta anche di un sistema di coltivazione che vieta l'uso di fertilizzanti chimici e pesticidi sintetici.