Lilli Langohr ist eine kleine Fledermaus, die mit ihrer Familie auf der Orgelempore des Ulmer Münsters wohnt. Dort lebt es sich nicht schlecht, wäre da nur nicht der alte, grauhaarige Organist Franz. Wenn er an der großen Orgel spielt, wird es oft so laut, dass Lilli kein Auge mehr zumachen kann. Eines Tages beschließt sie, sich im Münster einen neuen Schlafplatz zu suchen. Auf ihrem Flug durch die Kirche trifft sie einen mittelalterlichen Baumeister, der ihr vom Münsterbau erzählt, begegnet Engeln und Heiligen, Teufeln und anderen grimmigen Gestalten, von denen jede ihre eigene spannende Geschichte hat. Ob es Lilli gelingt, im einen neuen Ort zu finden, an dem sie sich wohlfühlt?