Les rivières constituent souvent le principal lien entre des écosystèmes en interaction. La pollution de l'eau présente deux aspects. L'impact humain sur les systèmes aquatiques tels que les rivières, les zones humides, les réservoirs et les eaux souterraines. Les effets indirects sont causés par l'utilisation des terres dans les bassins versants, tels que la déforestation, les plantations et les établissements humains. Le développement agricole et urbain intense a fait peser une forte demande sur les ressources en eaux souterraines dans les zones urbaines du monde entier et a également exposé ces ressources à un plus grand risque de contamination. Le risque de contamination des eaux souterraines est influencé par deux facteurs : (1) les propriétés intrinsèques du milieu hydrogéologique, principalement les facteurs qui influencent le transport et la stabilité des contaminants provenant de la surface du sol ; et (2) la charge de contaminants, principalement de sources anthropogéniques. Dans de nombreux cas, les zones urbaines présentent à la fois des propriétés intrinsèques et une charge de contaminants qui entraînent un risque élevé de contamination des eaux souterraines.