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La région de N'Zérékoré compte 6 districts sanitaires avec une population totale 1 696 807 habitants en 2015 [1]. La prévalence du VIH est de 1,6% en guinée, avec 120 000 personnes dont 65000 femmes [2]. En Guinée pendant l'épidémie de la maladie à virus Ebola, la région de N'Zérékoré a été la plus affectée entraînant des dysfonctionnements des services de santé. L'objectif de cette étude était d'apprécier l'impact de l'épidémie de la maladie à virus Ebola sur la PTME du VIH. Elle couvre une période de 4 ans et a porté sur les femmes enceintes séropositives et leurs enfants dans 19 centres de santé. Nous avons trouvé 0.88% de prévalence et un taux d'acceptation de 44.03%. Les ménagères représentent 64%. Le taux d'achèvement du traitement d'ARV a diminué de 54.95% à 23.23%. Le nombre de perdus de vues a augmenté pendant l'épidémie d'Ebola. Par contre, le taux d'accouchement assistés a diminué de 94.87% à 69.17% p = 8.126e-06. De même le nombre d'enfants protégés a diminuée de 50.55% à 16.67%. La PTME du VIH a été négativement impactée, cela se traduit par la diminution du nombre d'accouchements assistés, l'augmentation du nombre de perdus de vue, ruptures etc.