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Le processus d'urbanisation que connaissent les grands centres urbains a eu un impact considérable sur la quantité et surtout la qualité de l'eau. Le bassin de la rivière Guaraçau, situé dans la partie nord de la municipalité de Guarulhos, comprend des zones rurales et urbaines avec différentes classes d'utilisation des sols. Pour évaluer la qualité de l'environnement, des analyses physico-chimiques de la température, du pH, de la turbidité, de la conductivité et du phosphore total ont été effectuées, ainsi qu'une analyse microbiologique (E. coli) sur une période de 12 mois. L'eau de surface du ruisseau Guaraçau dans la zone rurale est déjà compromise, avec une détérioration de la qualité de l'eau d'amont en aval pour les paramètres phosphore total et E. coli, indiquant une contamination fécale due au manque d'assainissement de base dans la région. Les sites caractéristiques des zones rurales montrent déjà de sérieux signes de dégradation, avec des niveaux trophiques allant d'oligotrophes à hypereutrophes. Cela renforce la nécessité de construire un réseau de collecte et de traitement des eaux usées à la station d'épuration de Bonsucesso, inaugurée en 2011, et de contrôler l'occupation dans les zones qui produisent de l'eau de bonne qualité.