Un déclin des espèces de zooplancton a été observé avant 2000 et s'est poursuivi jusqu'en 2010. Seule une des neuf espèces de Cladocères enregistrées en 1996/1997 a été retrouvée en 2010. Sur les cinq espèces de copépodes enregistrées en 1996/1997, une seule, Acartia tonsa, a été observée après 2000. Aucun impact de M. leidyi sur les espèces de zooplancton n'a pu être vérifié en comparant la moyenne annuelle de l'abondance du zooplancton, en particulier celle d'A. tonsa, en 1996/1997, avant l'invasion de M. leidyi, et après l'invasion de 2001 à 2010. La raison de la disparition des espèces de copépodes et de cladocères n'est pas due à la sélectivité de l'alimentation des différentes espèces par M. leidyi, car ce dernier se nourrit de manière non sélective. Le changement climatique, la sécheresse, l'activité anthropogénique, la surpêche et l'augmentation de la charge de polluants par le ruissellement des rivières peuvent jouer un rôle important dans l'augmentation de la population de zooplancton et la perte d'espèces endémiques dans le sud de la mer Caspienne.
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