L'application de HIS dans les hôpitaux dans la prise de décision a plusieurs défis, y compris le manque de mise à jour des composants matériels et logiciels En outre, l'absence d'un spécifique, en se concentrant sur le développement de leur personnel technique, et la mobilisation des ressources financières pour réaliser la mise en oeuvre correctement. Par conséquent, il est recommandé d'établir la gestion technique avec des rôles et des tâches clairs et multidisciplinaires, et d'augmenter le soutien de la direction administrative dans le processus de mise en oeuvre du SIH.L'application de l'information sanitaire informatisée dans les hôpitaux aidera la direction et l'organisation à prendre des décisions hautement qualifiées en fonction des données factuelles, les décisions médicales et administratives s'amélioreront continuellement et le processus d'échec sera réduit.L'efficacité et l'efficience financières seront améliorées et la gestion deviendra plus performante.
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