Les lycopodes et les fougères sont des plantes vasculaires qui poussent dans différentes communautés végétales ; toutefois, peu d'espèces ont été signalées dans la forêt tropicale à feuilles caduques. Ces plantes sont importantes d'un point de vue écologique, car elles influencent l'accumulation de nutriments, les processus de décomposition et augmentent la fixation d'azote dans la litière, et sont des bioindicateurs de la conservation et des perturbations. La flore des ptéridobiontes de Guanajuato a augmenté ces dernières années avec l'exploration des zones naturelles protégées et des municipalités.