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La problemática creciente de los daños causados por los Begomovirus en los cultivos de importancia económica ha generado un impacto considerable en el ámbito ecológico, social y cultural. Su incidencia y severidad es cada día más alarmante dentro de los distintos sistemas de producción agrícola, siendo su principal hospedero el cultivo de tomate. Debido a esto, a través de varios años, han surgido técnicas moleculares y genéticas encaminadas a conocer de manera precisa los mecanismos de acción y respuesta que se llevan a cabo durante la interacción planta-virus. Su finalidad es elucidar los procesos involucrados en la expresión fisiológica de la planta y el patógeno, y a partir de ello, contrarrestar, inhibir, mitigar y/o eliminar las enfermedades transmitidas por este y otros tipos de virus. El presente documento monográfico presenta información básica sobre las características de los Begomovirus, su mecanismo de infección y las actuales técnicas moleculares agrupadas dentro de las herramientas "omicas" para el manejo y control de estos patógenos. Se espera que este documento pueda ser útil en el conocimiento de las principales enfermedades virales de las plantas.