La protuberancia es crucial para el sueño REM. La pérdida del sueño se produce cuando se dañan las partes superiores de los hemisferios cerebrales. El sueño REM está supervisado por la activación colinérgica en la región de la protuberancia del tronco cerebral. Ahora se postula que el sueño podría ser un proceso dopaminérgico que ocurre en las áreas límbicas y frontales del cerebro de los mamíferos. La neurociencia nos lleva a una nueva conciencia respecto a los sueños y el sueño. Por el momento, se comprende mejor que los estados de sueño afectan a las estructuras cerebrales y al estado de ánimo que los estados de sueño afectan a ambos. La neurociencia considera que los sueños están relacionados con la consolidación de la memoria que tiene lugar en el cerebro durante el sueño. Esto incluye la reorganización y recodificación de los recuerdos en relación con los impulsos emocionales y también la transferencia de recuerdos entre regiones del cerebro. Los sueños eróticos están causados por la activación del tronco cerebral durante el sueño de movimientos oculares rápidos (REM) y la estimulación del sistema límbico. Experimentalmente, las ratas de laboratorio privadas de ese precioso sueño REM durante cuatro días producen menos células nerviosas en el hipocampo, el centro de la memoria del cerebro. En los humanos, soñar puede ayudar a aliviar la depresión.
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