MANTRA : Base de données de Manchester sur l'ARNt et les séquences apparentées
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L'ARN de transfert, représentation de Sprinzl (feuille de trèfle), est un simple brin de 75 à 90 nucléotides plié pour donner une forme précise, qui agit comme un intermédiaire entre l'ARNm et la protéine. Compte tenu de la valeur de la structure secondaire, j'ai créé une base de données appelée MANTRA : Manchester Database of tRNA and related sequences (Base de données de Manchester sur l'ARNt et les séquences apparentées). Elle contient des ARNt collectés auprès de divers organismes et disponibles dans différentes bases de données, dont j'ai prédit la structure secondaire...
L'ARN de transfert, représentation de Sprinzl (feuille de trèfle), est un simple brin de 75 à 90 nucléotides plié pour donner une forme précise, qui agit comme un intermédiaire entre l'ARNm et la protéine. Compte tenu de la valeur de la structure secondaire, j'ai créé une base de données appelée MANTRA : Manchester Database of tRNA and related sequences (Base de données de Manchester sur l'ARNt et les séquences apparentées). Elle contient des ARNt collectés auprès de divers organismes et disponibles dans différentes bases de données, dont j'ai prédit la structure secondaire, et je l'ai rendue accessible sur un seul site. La vue d'ensemble de l'architecture de la base de données, c'est-à-dire la modélisation visuelle de la base de données ARNt, a été réalisée en appliquant le langage de modélisation unifié [UML] à l'aide de Rational Rose 98i. Les logiciels clustalW et DCSE (Dedicated Comparative Sequence Editor) ont été utilisés pour prédire et valider la structure secondaire de ces ARNt. L'objectif est d'utiliser les données de ces bases avec un moteur de recherche convivial pour que les étudiants et les chercheurs puissent facilement trouver des séquences d'ARNt avec leur structure secondaire afin de trouver des réponses et d'approfondir leurs recherches.
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