MANTRA: database di Manchester di tRNA e sequenze correlate
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L'RNA di trasferimento (Rappresentazione di Sprinzl, Foglia di Trifoglio), è un filamento singolo di 75-90 nucleotidi ripiegato per dare una forma precisa, che agisce come intermedio tra l'mRNA e le proteine. Considerando il valore della struttura secondaria, ho creato un database chiamato MANTRA: Manchester Database of tRNA and related sequences. Questo contiene tRNA raccolti da vari organismi e disponibili in diversi database, di cui è stata prevista la struttura secondaria, e lo ha reso accessibile in un unico sito. La panoramica architettonica del database, ovvero la modellazione visiva ...
L'RNA di trasferimento (Rappresentazione di Sprinzl, Foglia di Trifoglio), è un filamento singolo di 75-90 nucleotidi ripiegato per dare una forma precisa, che agisce come intermedio tra l'mRNA e le proteine. Considerando il valore della struttura secondaria, ho creato un database chiamato MANTRA: Manchester Database of tRNA and related sequences. Questo contiene tRNA raccolti da vari organismi e disponibili in diversi database, di cui è stata prevista la struttura secondaria, e lo ha reso accessibile in un unico sito. La panoramica architettonica del database, ovvero la modellazione visiva del database di tRNA, è stata realizzata applicando il linguaggio di modellazione unificato [UML] con Rational Rose 98i. Per prevedere e convalidare la struttura secondaria di questi tRNA sono stati utilizzati i software clustalW e DCSE (Dedicated Comparative Sequence Editor). L'intenzione è quella di utilizzare i dati di questo database con un motore di ricerca facile da usare per studenti e ricercatori, in modo da trovare facilmente le sequenze di tRNA con la loro struttura secondaria per trovare risposte e approfondire le loro ricerche.
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