Il Manuale è composto da tre capitoli, il primo capitolo tratta gli aspetti generali della batteriologia e l'approccio sistematico. In questa parte viene trattata la relazione ospite-batteri su scala di popolazioni e individui, su scala cellulare e molecolare, nonché la relazione con il sistema immunitario, la variazione antigenica e la progettazione del vaccino. Nella parte specifica si tratta di Batteri responsabili di infezioni generalizzate, infezioni dell'apparato digerente, infezioni dell'albero urinario, malattie sessualmente trasmissibili, infezioni dell'apparato respiratorio e otorinolaringoiatrico, meningiti e infezioni della pelle. Vengono così studiati tredici batteri patogeni appartenenti a diversi gruppi: Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus, Pneumococci, Neisseria meningitidis, Neisseria gonorrhoeae, Vibrio cholerae, Yersinia pestis, Bacillus anthracis, Clostridium botulinum, Clostridium tetani, Clostridium perfrigens, Mycobacterium tuberculosis e Mycobacterium leprae. Infine, vengono descritti i metodi per diagnosticare le malattie infettive batteriche.