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A causa della mancanza di criteri di selezione adeguati, lo sviluppo di varietà ad alto rendimento altamente tolleranti al sale nel riso rimane un episodio incompleto e in questo bivio i marcatori molecolari trovano un posto appropriato su cui utilizzare. Questi sono più potenziali; avere una risoluzione migliore e non essere influenzato dal cambiamento dell'ambiente. Nel presente studio sono stati compiuti sforzi per etichettare i geni tolleranti al sale in una mappatura F3 di Pokkali X IR 28 con fenotipizzazione simultanea in risposta all'eccesso di sale in condizioni artificiali. Il risultato mostra un ampio polimorfismo rispetto a 10 primer decamer, che è essenziale per un programma di marcatori molecolari nella mappatura del gene di interesse. Da questo studio, si può concludere che RAPD può essere utilizzato senza esitazione per contrassegnare il gene (i) per la tolleranza al sale nel riso. Le presenti informazioni sono sufficienti perché RAPD possa essere utilizzato come sistema di marker affidabile, facile da maneggiare ed economico nel profilo molecolare dei segreganti F3.