I farmaci intracanali sono utilizzati per la disinfezione del canale radicolare. Come parte dell'asepsi controllata, il loro ruolo è secondario alla pulizia e alla sagomatura del canale radicolare. La natura chimica dei medicamenti impiegati è varia; essi provengono da un certo numero di gruppi diversi, spesso diverse sostanze chimiche o farmaci sono combinati in una "coda di cazzo" nel tentativo di suscitare una varietà di effetti con una sola applicazione. Grazie ai progressi nel campo medico e della ricerca, sono stati introdotti nuovi approcci come la disinfezione fotoattivata, gli ultrasuoni, l'endox, l'ozono, il laser e l'acqua attivata elettrochimicamente per la disinfezione del canale radicolare. Pertanto, per inattivare questo carico infiammatorio batterico, è necessario utilizzare farmaci intracanalari antibatterici di lunga durata tra gli appuntamenti endodontici.