Os medicamentos intra-anal são utilizados para a desinfecção dos canais radiculares. Como parte de uma assepsia controlada, o seu papel é secundário à limpeza e moldagem do canal radicular. A natureza química dos medicamentos empregues é variada -; eles provêm de vários grupos diferentes, muitas vezes produtos químicos ou drogas diferentes são combinados numa "cauda de galo", numa tentativa de obter uma variedade de efeitos com uma única aplicação. Devido ao avanço nos campos médicos e de investigação, foram introduzidas novas abordagens como a desinfecção fotoactiva, ultra-sónica, endox, ozono, lasers e água activada electroquimicamente para a desinfecção do canal radicular. Portanto, para inactivar esta carga inflamatória bacteriana, é necessário utilizar medicação antibacteriana intracanal de longa duração entre as consultas endodônticas.