Los microorganismos desempeñan un papel importante en el desarrollo y la progresión de las enfermedades pulpares y periapicales. El objetivo principal de la terapia endodóntica es erradicar la infección del conducto radicular y crear un entorno en el que los microorganismos residuales no puedan sobrevivir. Esto puede lograrse empleando una combinación de técnicas de tratamiento aséptico, preparación quimio-mecánica del conducto radicular, soluciones de irrigación antimicrobianas y medicamentos intracanales. Los medicamentos intracanales incluirían cualquier agente con acción farmacológica prevista introducido en el conducto radicular. Mientras que las soluciones de irrigación también demuestran una acción antibacteriana, los medicamentos intracanales describen de forma más concisa los medicamentos que se dejan en el conducto radicular para que ejerzan sus efectos durante un periodo de tiempo más largo. Entre los agentes más conocidos se encuentran el hidróxido de calcio, los antibióticos, los biocidas no fenólicos, los biocidas fenólicos y los compuestos de yodo. Su elección depende del estado pulpar y periapical del caso a tratar.
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