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I farmaci a base di erbe (medicina botanica, fitomedicina o fitoterapia) si riferiscono a erbe, materiali a base di erbe, preparazioni a base di erbe e prodotti finiti a base di erbe che contengono parti di piante o altri materiali come ingredienti attivi. Oggi i prodotti a base di erbe o naturali sono diventati più popolari grazie alla loro elevata attività antimicrobica, alla biocompatibilità, alle proprietà antinfiammatorie e antiossidanti. Oggi i farmaci a base di erbe vengono introdotti nelle paste dentarie per prevenire la carie. La proprietà anticariogena dei polifenoli è dovuta principalmente a un effetto diretto contro S. mutans. Inibiscono l'adesione delle cellule batteriche alla superficie del dente interagendo con le proteine della membrana microbica. In endodonzia le erbe sono utilizzate principalmente per la disinfezione del canale radicolare. La ricerca sugli irriganti a base di erbe è in aumento a causa degli effetti negativi della maggior parte dei farmaci sintetici intracanalari.