En las últimas décadas, la innovación es un concepto que ha adquirido relevancia en el mundo académico, debido a la importancia de la misma en el contexto actual de la globalización, que impone desafíos a los territorios para desarrollar nuevas estrategias en su inserción en la economía internacional. En tal sentido, la presente investigación se sostiene sobre los nuevos marcos teóricos y analíticos, que dan cuenta que la innovación es un proceso que depende en gran medida del medio o entorno en el cual tiene lugar, esto implica un abordaje territorial de la innovación más allá de la definición clásica schumpeteriana. De este modo, se trata de analizar a partir del estudio de caso de un programa enmarcado en la política pública llevada a cabo por la Agencia Nacional de Investigación e Innovación (ANII), la concepción de innovación de los actores territoriales involucrados en dichos procesos, las redes territoriales que se conforman y las restricciones del entorno que dificultan la territorialización de la innovación.