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A aquacultura na África Oriental está a emergir como uma importante indústria de mudança económica ambiental e social; está a começar a contribuir para a segurança alimentar, a melhoria da qualidade de vida e dos rendimentos. Na última década, a intensificação e a comercialização de empresas de piscicultura têm sido significativas. A piscicultura faz parte da agenda política de desenvolvimento de todos os países da África Oriental, com planos e estratégias para desenvolver a piscicultura comercial em pequena e grande escala. Espera-se ainda que o aumento da produção de peixe de aquacultura seja fundamental para reduzir o fosso entre a oferta e a procura crescente de peixe. Aparentemente, o Uganda actua como um centro regional (Comunidade da África Oriental/EAC) de aquacultura, fornecendo insumos de aquacultura (ração e sementes de peixe) e peixe produzido em cultura aos países vizinhos. No entanto, foram registados no Uganda casos de doenças infecciosas causadas por bactérias, parasitas e fungos, incluindo mortalidades inexplicáveis, tanto nas maternidades como nas explorações de crescimento. Este facto, entre outros, deve-se à revelação de falhas significativas nos sistemas de biossegurança, tanto a nível das explorações como a nível nacional.