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Der menschliche Stoffwechsel und der Klimawandel können die Evolution von Superbugs und neu auftretenden Viren modulieren. Ballaststoffe und Humanarzneimittel - Antibiotika und Nicht-Antibiotika können die Darmflora modulieren, indem sie das archaische Wachstum des Dickdarms und die Endosymbiose, die den Klimawandel, die Entwicklung von Superbugs und neu auftretenden Viren und den Krankheitsphänotyp hervorrufen, beeinflussen. Eine ballaststoffarme Ernährung mit einem Anstieg an Proteinen und Fett führt zu einer Stimulation des endosymbiotischen und kolonarchalischen Wachstums. Die Kolonarchaeen übertragen durch natürliche Selektion und DNA/Gen-Austausch mit anderen kolonalen und endosymbiotischen Organismen die Gene für die Antibiotikaresistenz auf andere Kolonflora. Die Kolonarchaeen erzeugen auch RNA-Viroide, die durch die kolonepitheliale HERV-Reverse-Transkriptase in DNA-Viroide umgewandelt und in das Kolon-Genom integriert werden. Die RNA- und DNA-Viroide hybridisieren mit der viroidalen und bakteriellen Population des Darmmikrobioms und der Virobiom-DNA und -RNA des Darms, was zur Bildung neuer, neu entstehender Viren führt.