Em condições naturais, as plantas estão, normalmente, rodeadas por uma série de potenciais inimigos. Estas criaram estratégias de defesa contra o ataque de agentes patogénicos e herbívoros, permitindo a sua perpetuação ao longo da evolução. Estes mecanismos de defesa estão intimamente associados à síntese de metabolitos secundários, que são também mundialmente utilizados em diversas áreas da indústria. Este livro aborda de uma forma sistemática como as plantas sintetizam estas substâncias em resposta a estímulos bióticos ou abióticos. Através deste livro revelamos que a síntese de metabolitos secundários vegetais está dependente de alterações em várias vias metabólicas, estando muitas vezes diretamente associadas ao metabolismo primário. Atualmente, as ferramentas genómicas têm sido alternativas úteis que estão a conduzir a uma nova revolução no melhoramento de plantas, permitindo a sobre-expressão ou inibição destas substâncias. São apresentadas algumas limitações e desafios a serem alcançados sobre a dinâmica da síntese de metabólitos secundários em plantas.